La actividad analítica de FITOSOIL queda estructurada en seis departamentos básicos :

- MUESTREO - FISICO-QUIMICO - MICROBIOLOGIA - FITOPATOLOGIA - CROMATOGRAFÍA Y RESIDUOS DE PLAGUICIDAS - I+D+I

Cada uno de ellos, especializado en su campo, posee autonomía técnica propia, estando todos ellos integrados en un sistema que coordina las diferentes áreas.